6月16日晚，北京市政府副秘书长陈蓓宣布，北京应急响应级别由三级提升到二级。从6月11日至15日，北京市连续5天报告106例新冠肺炎确诊病例，均与北京新发地市场有关。因出现确诊病例，北京16个区中已有9个区的20多个街乡疫情风险等级提升。
北京此起聚集性疫情已波及9个区28个街道，包括在三个省市引发了相关病例，本起聚集性疫情初步判断由人际传播或物品环境污染引发的感染所致，且密切接触者中出现了明确的续发感染，这些情况再次给敲响了警钟。
从6月17日起，中小学各年级一律停止到校上课。各学校要及时将通知告知每一名学生家长，同时做好线上教学的无缝衔接，做好心理疏导和家长沟通，确保学生平稳进入居家学习。同时，已复园的大班幼儿一律停止来上课，全市各类型幼儿园均不再开园。
相关当局表示北京市发生新发地批发市场聚集性疫情，防控形势十分严峻，要强化底线思维，背水一战，把疫情防控作为当前最重要、最紧迫的任务来抓，争分夺秒、主动出击，始终跑在疫情前面，采取最坚决、最果断、最严格的措施，做到“应查尽查、应检尽检、应隔尽隔、应收尽收”，坚决阻断传播渠道，坚决遏制疫情扩散蔓延，确保人民群众生命安全和身体健康，确保北京安全。
发布会上，北京市疾控中心副主任庞星火通报了最新确诊病例相关情况。
庞星火提醒，市民朋友如近期曾去过新发地市场，请不要随意外出，并如实向单位和社区报告，按照社区的安排进行核酸筛查。自觉做好个人防护，减少聚会、聚餐；坚持科学正确佩戴口罩，在人员密集或封闭拥挤场所，乘坐公共交通工具，必须佩戴口罩；保持社交距离，不要小于1米近距离接触；保持勤洗手、常通风等良好的卫生习惯；服从单位、社区、公共场所查证、验码、登记等防控措施管理；认真做好个人健康监测，如出现发热、咽痛、咳嗽等症状要及时就近诊疗，并主动向接诊医生告知接触史等情况。
